【R】アーカイブされたパッケージを使う

はじめに

因果推論を勉強している人にはおなじみの Mixtape ですが、昨年勉強中にこの中の合成コントロール法の章でパッケージがインストールできない問題に直面しました。

よく調べてみると、当時¹ SCtools パッケージはアーカイブされてしまっており、install.packages('SCtools') ではインストールができないことが判明しました。

現在²では復活してインストールできるようになっていますが、そんなときに備えて対処法をまとめます。

作業の流れ

アーカイブされたパッケージを探す

CRAN のアーカイブにアクセスして、アーカイブされたパッケージを探します。

例えば当時アーカイブされていた SCtools を探すと、次のようになります。

この中で最新のものを右クリックし、リンクをコピーしてください。

RStudio を開く

続いて RStudio を開き、スクリプトに次のコードを入力してください。

url <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/SCtools/SCtools_0.3.2.tar.gz"
pkgFile <- "SCtools_0.3.2.tar.gz"
download.file(url = url, destfile = pkgFile)

ここで URL はコピーしたものに変え、pkgFile は URL の最後の .tar.gz 部分をコピペしてください。

実行するとエラーが出るかもしれませんが、それは依存しているパッケージがインストールされていないということです。エラーを読んでみて、足りなそうなパッケージを以下のコードの c() にまとめて入れて実行し、改めて download.file() を実行してみてください。

install.packages(c("xxx", "yyy", "zzz"))

そしてパッケージをインストールします。次のコードを実行してください。

install.packages(pkgs=pkgFile, type="source", repos=NULL)

最後に以下を実行して下さい。

unlink(pkgFile)

以上です。インストール出来たのではないでしょうか。

おわりに

備忘録的にアーカイブされたパッケージのインストール方法をまとめました。

出会ってしまった際にはご活用ください。

参考

stackoverflow

CRANから消えた”Archived R package”をインストールしたい

注

2023年秋↩︎
2024年5月16日↩︎

--- title: 【R】アーカイブされたパッケージを使う description: 'パッケージがインストールできない？ ' date: 2024-05-16 date-modified: last-modified categories: - R aliases: - /pages/tips/240516_archived_pkg/index.html --- ## はじめに因果推論を勉強している人にはおなじみの [Mixtape](https://mixtape.scunning.com/) ですが、昨年勉強中にこの中の合成コントロール法の章でパッケージがインストールできない問題に直面しました。よく調べてみると、当時^[2023年秋] `SCtools` パッケージはアーカイブされてしまっており、`install.packages('SCtools')` ではインストールができないことが判明しました。現在^[2024年5月16日]では復活してインストールできるようになっていますが、そんなときに備えて対処法をまとめます。 ## 作業の流れ ### アーカイブされたパッケージを探す CRAN の[アーカイブ](https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/)にアクセスして、アーカイブされたパッケージを探します。例えば当時アーカイブされていた `SCtools` を探すと、次のようになります。 ![](sctools-archived.png) この中で最新のものを右クリックし、リンクをコピーしてください。 ### RStudio を開く続いて RStudio を開き、スクリプトに次のコードを入力してください。 ```{.r filename="R"} url <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/SCtools/SCtools_0.3.2.tar.gz" pkgFile <- "SCtools_0.3.2.tar.gz" download.file(url = url, destfile = pkgFile) ``` ここで URL はコピーしたものに変え、`pkgFile` は URL の最後の `.tar.gz` 部分をコピペしてください。実行するとエラーが出るかもしれませんが、それは依存しているパッケージがインストールされていないということです。エラーを読んでみて、足りなそうなパッケージを以下のコードの `c()` にまとめて入れて実行し、改めて `download.file()` を実行してみてください。 ```{.r filename="R"} install.packages(c("xxx", "yyy", "zzz")) ``` そしてパッケージをインストールします。次のコードを実行してください。 ```{.r filename="R"} install.packages(pkgs=pkgFile, type="source", repos=NULL) ``` 最後に以下を実行して下さい。 ```{.r filename="R"} unlink(pkgFile) ``` 以上です。インストール出来たのではないでしょうか。 ## おわりに備忘録的にアーカイブされたパッケージのインストール方法をまとめました。出会ってしまった際にはご活用ください。 ## 参考 :::{.callout-tip appearance="minimal"} [stackoverflow](https://stackoverflow.com/questions/24194409/how-do-i-install-a-package-that-has-been-archived-from-cran) ::: :::{.callout-tip appearance="minimal"} [CRANから消えた"Archived R package"をインストールしたい](https://yoshi-nishikawa.hatenablog.com/entry/2017/10/27/143615) :::